Ишимский историко-краеведческий музей открывался в 1923 году, в 42-м его деятельность приостановили, для размещения в его помещениях эвакуационных госпиталей, в 53-м музей и вовсе расформировали.
Музей был воссоздан в 1991 году в здании бывшей церковноприходской школы. Сейчас в нем размещены постоянные коллекции музея истории Приишимского края и выставки фондов Ишимского историко-краеведческого музея и других музеев России.
С 1995 года начался сбор и экспонирование коллекции материалов об Ишимском восстании 1921 года: фотодокументы, плакаты, воззвания и приказы, советские агитационные плакаты.